Моделирование мембранных белков

Рассмотрим получение модели НР – сополимера, имитирующей мембранные белки. В этом случае неполярную прослойку обозначим как Н-звенья, а полярные опушки как Р. На долю Н – звеньев приходится 30 %, а на долю Р – 70%. Введём различные энергетические параметры (eРР, eНР, eРР). При этом eНН > eРР. При моделировании происходит диффузия Н и Р звеньев. Поэтому для улучшения структуры процедуру модифицирования производят много раз. [20]

Рис. 2.6. Нативная конформация мембранного белковоподобного сополимера (слева) и конформация, полученная после равновесия в компьютерном моделировании (справа); N = 256.[20]

Из рис. 2.6. можно видеть главную особенность таких структур – эффект стабильности микросегрегированной структуры. Таким образом, можно сказать, что подобная модель «наследует» свойства мембранных мелков.

Смотрите также

Понятие химических реакций и их классификация
Вещества, взаимодействуя друг с другом, подвергаются различным изменениям и превращениям. Например, бериллий взаимодействуя с кислородом воздуха при температуре свыше 500оС, превращается в ...

Вулканизация каучуков
Фторкаучуки вулканизуются при нагревании смесей, содержащих вулканизующие агенты, или под действием излучений высокой энергии. Степень радиационной вулканизации фторкаучуков тем выше, чем больше со ...

Обескремнивание вод
...